Filmin ilk serisi izleyenlere bol komedi ve eğlenceli anlar yaşatmıştı. Madagaskar filminin 2. Filmi olan bu film hayvanat bahçesinden firar eden Su Aygırı Gloria, Zebra Marty, Aslan Alex, Zürafa Melman dışında sevimli penguenler ve haylaz şempanzeler ile çok keyifli anlar yaşatacaklar. Kendilerini Madagaskar’ın muhteşem sahillerinde bulan bu eğlenceli arkadaş grubu, hayvanat bahçesi kadar güvenilir olmayan bu yerde bazı problemler ile karşı karşıya kalacaklar. Tek amaçları penguenlerden kurtulmak olan bu hayvanat bahçesi üyeleri, bir uçağı tamir etmek ve penguenlerden kurtulmak için havalanırlar. Lakin hiç bir şey umdukları gitmez ve kendilerini bir anda Afrika ormanlarında ve kendilerine benzeyen hayvanlar içinde bulurlar. Afrika ormanlarında bu sıkı dostları hangi maceralar bekliyor?
